第六关：
深海潜水 - Deepsea Dive
穿着笨重的金属潜水服潜入深海，动作虽然很不灵活，但却不用为缺氧而担心。往前游去，在岔路处先往右游到一个小海沟中，这里有向你发射微型鱼雷的小潜水器，此时你可以按下“加速跑”键甩出诱饵引开微型鱼雷(若被击中也无大碍)。在这里最远处的左下方德国潜艇旁可找到一个小洞穴，里面有本关唯一的朵黄金玫瑰，之后返回出发点的岔路处。
回到岔路口，这次往左边游去，进入另一小海沟，从远处接近角位的左侧游入一条水道，从而到达另一区域，从下方的大洞游进去，并一直游到最深处(要记住来到这里的路线)，便可从那个柳条箱中找到命运之矛的矛头。
突然水中震动两下，头顶的钢筋坠了下来，正恰砸破了Lara的潜水服(立即存档)。此时Lara将面临着缺氧窒息的危险，所以必须赶在氧气耗尽之前一直游回本关出发点俄罗斯潜艇的降梯道中(必要时需使用药品，或取档，可多试几次)。
第七关：
正在沉没的潜艇 - Sinking Submarine
又回到了潜艇上，当Lara脱掉潜水服时，就被那个俄罗斯人逮个正着，他逼迫Lara交出命运之矛的矛头，Lara说，只有维护世界和平的人才能被这命运之矛所接受。那个俄罗斯人最终还是把它骗到了手，谁知矛头却偏偏惩罚了这个一心想统治世界的恶棍 —— 随着大爆炸，潜艇内部系统发生混乱，多处发生短路与爆炸，外面的海水开始不住地灌进这艘处于深海海底的潜艇中。在周围突然变得暗淡时，Lara利索地收拾了旁边两名士兵，现在要做的，只能是尽快想办法逃出这艘潜艇。
爬下梯子，干掉两名士兵(从一人身上得到弹药)，继续走攀上梯子，在岔路处走右侧通道，跳过两处火堆(若被烧到则立即地滚翻可在浅水中灭火，中途进入两处火堆中间的左侧房间，可在木架上重新找到Uzie冲锋枪)，最后抵达餐厅前。此时看到几根高压电线落入餐厅里的水中，这将意味着在这里暂时不能涉水前进，于是利用餐桌依次跳到对面的另一侧通道中，里面右侧的门已被开启，进入里面干掉一名起初背对着你的士兵，并从他身上得到一张磁卡，还能在其中一木架上找到小药包。
下面通过餐厅中的餐桌返回原来通道中的两堆火焰处，再次跳过两堆火焰，这次走右侧通道，在尽头利用磁卡进入一条新的通道。
由于里面右侧的通道中有高压电线阻挡，故先攀上前方的梯子，在岔路处直走进入前方三道水帘后的通道，来到驾驶指挥舱。这里的水中没有电，到达里面另一侧转动轮擎进入一间小舱，见到了那名军官，遗憾地独自坐在角落痛苦着，据他说，原来被命运之矛头击死的那个人是一名逃犯，是他引起了这一切的不幸，军官给了Lara一把钥匙，还告诉了她逃生的方法。之后Lara返回外面的驾驶舱，登上铺着地图的桌子，会发现一侧上方的排气百叶窗已经松动了，于是跳起来击碎它并跳攀进入，走右侧通道，在尽头掀开丝网地板活门跳下去，在下面的小房间内，靠墙跳起来抓住高处的手擎拉下，从而关掉潜艇内部的所有电源。返回到驾驶指挥舱，
并回到外面的通道中，进入旁边另一个驾驶舱，涉水探索，可在这里得到一罐氮气、一把沙漠之鹰手枪、大药箱和弹药。出来后右转爬下梯子，这次就可以进入此时左侧的通道了(伸入水中的电线已不再带电)，涉水过去使用军官给你的钥匙开启尽头的铁门，进入会议室，在这里两侧的四个柜子中可得到一罐氧气和一个小药包，在返回时需要干掉两名士兵，并可从一人身上得到一把钥匙。
沿左侧通道回到餐厅(这里伸入水中的电线已经不带电了)，这次可以继续回到厨房(先前关曾在这里打死一名厨师)，可在地上的浅水中得到第一朵黄金玫瑰。最后一直返回到军官所在的小舱外面的驾驶指挥舱中(路线自己找找吧，途中已没有任何敌人)。到了驾驶指挥舱中，再次借助那张铺着地图的桌子跳攀进入上方的低矮通道，并再次进入刚才关掉所有电源的小房间里，用刚得到的钥匙开启里面黑暗中的一扇铁门，在里面的抽屉中可得到第二朵黄金玫瑰。
最后一次回到驾驶指挥舱中，并来到军官所在的小房间，攀上旁边的梯子，到达上方，先将氮气罐装入左侧装置中，之后再将氧气罐装入身后的装置中。当Lara爬下来要救那名军官时，却被军官拒绝了：即使他回到海面仍无法摆脱敌人的追击;而最重要的，就是这艘潜艇未能完成它的使命，应该在大海中安息了，而身为一舰之长的军官也永远不应该离开。
在未来，当人们还记得这艘潜艇时，就会想起他 —— 曾经一名出色的俄罗斯军官。他还为被命运之矛头击死的那个人感到耻辱，实际上是那个人为了达到自己的目的，而利用某中手段迫使他们做出了一些危险的行动。军官祝福Lara，并与Lara永别。
当Lara再次独自爬上救生舱时，身后的铁板门被自动紧紧地关闭起来，在整个潜艇发生大爆炸之前，Lara逃生了。在岸上守候的让.伊夫看到雷达上的信号，以为是敌人，端好狙击枪瞄准救生舱里的人，幸好他看清了那是Lara的脸……
