第十一关 奥西拉（OSCEOLLA）
我们终于肯定了超级突变人首领的身份，这个自称Gammorin的家伙极有可能是从前效力于兄弟会的Latham圣骑士，他曾经是兄弟会的高傲。大家都觉得他已经死了，然而沉静多年后Latham居然换了个身份再次涌现。如今兄弟会内部仍在运用的很多章程条例就出自Latham之手，难怪突变人会对我们的情况如此熟识。本次战役的重要义务是刺杀Latham，其次要救出Barnaky将军，有情报表明他就被关押在Latham身边。
地图正中央是超级突变人的基地，四周都有重兵巡逻，一交火就知道他们的厉害，清一色的M2重机枪，杀伤力惊人射程又远。先别忙进攻基地，把左右两侧地域的敌人消灭光。从基地大门杀进去对比困难，可到地图上标有2的红色圆圈处寻找秘道入口，通道另一头在基地里，出来难免一场恶战，不一定会比冲正门轻松。中央高台上的敌人借助沙袋工事持续顽抗，附近有很多油桶，可通过诱爆或扔手雷把他们一个个歼灭。地面上洁净之后从台阶进入地下掩体，里面不大，但注意有间房里布满了油桶，如果贸然冲进去双方对射时很可能会落个玉石俱焚的后果，最好的办法是从门外丢手雷进去。在隔壁碰上突变人小头目Toccomatta，这家伙受了重伤，居然把你当成Gammorin就开端报告，原来他被派去押送Barnaky将军，途中却遭遇不明怪物的袭击，那东西一个就干掉了他们整队人马。说完话Toccomatta就咽了气，从他身上搜出将军写给妻子的信件。
Gammorin和一个卫兵躲在中间的大屋里，门外有很多手持机枪的突变人出没，收拾他们比干掉Gammorin难多了。这个该死的叛徒居然拿的是一支汤姆森冲锋枪，就是二代中新里诺匪帮惯用的那种，难怪他那么菜，从尸体身上还可以找到一个文件包，到手后即可退却。从突变人基地北门出去后，在一艘飞船废墟旁会遇到疯子酒鬼Roshambo，他似乎是Latham从前的手下，如今也流于颓丧。注意北门外横贯东西两翼都埋了无数地雷，东北的高台上还趴着俩突变人。在地图右上角是个废弃垃圾场，在那里除了几个敌人外没什么值得拜访的东西。
经过这次战役，失去领袖的超级突变人部队土崩瓦解，他们再也无法与兄弟会反抗，而兄弟会也不失机会地招收了一些突变人兵源。Dekker将军下令再次搬家，我们向西来到了第四个基地——德尔塔，这里居然是露天的广场，认为比以前那些地堡让人舒畅多了。
第十二关 枢纽镇（JUNCTION CITY）
枢纽镇一直谢绝与兄弟会结盟，最近的一次战役中他们出人意料地击败了机器人的进攻，长老们对此认为困惑不解，为了揭开这个谜，你必须率队前往那里调查，同时还要收集被该镇所摧毁的机器人的四件残骸。热衷于机械的掠取者一族也在猖獗搜寻机器人零件，他们很可能会对镇上的安全构成威逼，而这正有利与我们与这个小镇达成合作。另外，兄弟会的首席机械师库特在最近突然牺牲，只有枢纽镇的机械师凯茜贝雷特可以接任这个职务，因此你必须全力说服她加入兄弟会的队伍。
开端时队伍涌现在枢纽镇南门外，往南走会遭遇几个掠取者，这些狂热崇拜科技的家伙居然拥有能量武器，不过在机关枪的扫射下他们显然不如突变人刚强。在最下方的小屋里找到奄奄一息的骗子Hank，桌上还有支离子步枪。他老婆Martha告诉我们，Hank原来拥有机器人的零件之一，但来了一帮掠取者抢走零件不说还把他打了个半死。进城到城北的房子里找到市长John Levis，他要你帮忙赶走北门外进攻的掠取者，如果成功才干把一块零件给你。整个队员杀出北门外赞助守镇的部队，敌人的激光武器相当厉害，我们要一直向东北挺进，直到攻陷掠取者占据的那栋两层楼的房子，这场战役也堪称游戏中最困难的战役之一，特别是二楼上趴在护栏往外射击的掠取者人又多，手里又是狙击步枪又是掷弹筒的。攻下这座房子后在一楼桌子上可找到原来属于Hank的那块零件，然后返回市长那里报功可以得到另一块。
和隔壁的市长秘书Anna谈谈可以探询到其它几块零件的下落。城东头Juans Emporium商店的老板手上有一块零件，花点部落货币买下来。在南门往左走有个男人在念叨谁买机器人零件，别理他，这是个骗子。接着到城中The Pit商店，这里的老板对兄弟会没有好感，所以虽然他手中有另一块零件却没法买下来，只能和他赌博，派个赌博技巧高的队员上去，多投点钱就能把那个零件给“博”回来。四块零件到手后该去城西南找机械师凯茜了，一进门就看见凯茜的父亲重伤卧床，Stitch二话没说掏出医疗包只消片刻就让老爷子痊愈，感激不敬的凯茜哪里还能谢绝我们劝告她加入兄弟会的一番诚意。
这次义务我们不但博得了一位不可多得的技巧人才，带回去的零件也让兄弟会的长老们增长了对机器人的理解，这些可贵的敌情资料将有助于我们在未来不可避免的冲突中更有效地克敌制胜。
第十三关 大河湾（GREAT BEND）
与机器人权势的战役终于打响，我们的情报员发明，上次袭击枢纽镇的机器人竟然来自一座战前的工业重镇大河湾。根据他们的接近侦查，那里确切有各种型号机器人的踪迹，估量敌人修复发电机后把这里改革成了机器人生产中心，如果情况属实，兄弟会必须摧毁这个机器人的大本营并切断电源，即使情报有误你也必须消灭该地域的所有机器怪物。
开端先和躲在废车后的Jake多谈几次话，得知这些机器人是两周前突然涌现的，本地居民不是被杀就是躲了起来。前面工事交错的街道上有好几个机器人扼守，如果大型枪械或能量武器等技巧熟练度不高要杀过去会很困难，这帮钢铁怪物的HP奇高，手里的家伙也丝毫不逊色，尤其不要让它们冲到跟前格斗，否则你绝对会后悔的。在Jake附近，你会发明在第二关自由港被你救出的那个女人Ripley，不过她已经被机器人屠戮了，查看她的尸体会得到六本技巧书和一本猫爪杂志，看来可怜的Ripley还真没有食言，多谢了!经过剧烈的战役杀到一扇铁门前，开门的电闸在左边的房子里，往下走的路在一截断桥处收场，接着向右持续突击，或者派队员从梯子下到横断南北的大壕沟里去，往东走几步可以找到一个只能蹲着钻进去的入口，爬出去后发明来到Mike的小房子里。Mike并不喜爱钢铁兄弟会，原因是他的姐姐Emma因为与一名匪帮成员谈恋爱被送进了劳改营，经过两个月的折磨后悲惨死去。
Mike的小屋左右两侧各有一座大型工厂，里面充斥着各种机器人，最恐怖的当属手上两把大剑的搬运机器工和发射能量武器的机器保安，尤其前者装有履带底盘，仗着HP高一路冲过来挥刀乱剁，死亡爪与其相比简直是小儿科，对付它最好用地雷阵。工厂里也有不少平民的尸体，仔细搜索还能发明不少好东西。持续往右前进又被垃圾路障挡住，改道进入废料场，里面也有不少机器人，逐步巷战全歼敌人后终于来到唯一一座通向南部的小桥前。折回垃圾路障的另一边可以找到Gloria，这个趴在一张破床上的女人因该算本地的商人，可以从她那里买到一本猫爪杂志。过桥进入小铁门后会遭到机器人的顽强抵抗，充沛利用掷弹筒杀伤躲在工事后的敌人。大河湾的南岸也有两座大工厂，里面的货色和北面差不多，但这里有个庞大的烟囱基座，可用来微妙阻杀那些烦人的搬运机器工。基座四面各有一根曲型支持钢管，人可以通过，但机器工无法通过，把敌人引到这里来让它们无法靠近，趁机从容开火歼灭。在第二座厂房的西边有间小屋，里面停放着一台巨型机器人的残骸，这也许是它们从前的首领。打开电闸从附近的铁门出去，消灭了附近残存的机器人后总部会通知你义务完成。
第十四关 冷水镇（Coldwater）
我们曾经为之战役过的昆西产生了叛乱事件，几个当地的恶棍给兄弟会战士下毒后偷走了武器装备溜到冷水镇，并在那里用这些装备为害乡里。问题的严重性在于他们盗走的动力盔甲是兄弟会的秘密装备，如果流入民间无疑会给我们带来极大隐患。因此必须尽快夺回动力盔甲并处分这些无耻的小偷。
冷水镇是座创造在梯形山腰上的城市，它的四个部分从低到高依次排列，从地图上看宛如梯田。我们在城市入口处遇到Auditor将军，他要在这里亲自等着我们拿回三套动力盔甲，将军还命令我们必须处死所有的盗贼。搜索第一层时在赌甲虫赛跑的处所遇到本地的黑社会人物Don Vinchenzo，他请我们去干掉Ma Baker，原因是她欠了他很多钱，而现在仗着有匪帮掩护就不想还，作为交换，Vinchenzo透露窃取盔甲的主谋是Guldo。在二楼右边的酒吧里，Simon Dudley恳求我们去救他的姐姐Adele，几个自称兄弟会的人绑走了她，小伙子带路把我们引到绑匪的门前，冲进去射倒正欲行非礼的恶棍，别用机关枪以免误伤人质，再和Simon谈话可得到一点报酬。扫清了第二层后接着往上走，Ma Baker在右边，不要杀她，因为她的真实身份是兄弟会在本地的卧底密探——Klotz骑士。
往左走会遇到大量敌人，干掉扼守楼梯的几个家伙后上到第四层。北面走廊里巡逻的三个敌人中有一个就穿着一套动力盔甲，打死他们后夺回盔甲。从右上角的门出去，沿途有大量地雷，端起机关前乱扫都会引起大爆炸。Guldo一伙躲在印有666的大房间中，直通外面的那扇门无法打开，必须从右侧的入口绕进去，刚进门就遭到敌人迎头痛击，打死他们后在其中一具尸体上发明第二套盔甲。把墙边的电闸拉下，在阴暗的光线下摸进去与敌人展开混战，身着动力盔甲的Guldo临死前透露了他对兄弟会强权的厌倦，然而身为军人的我们还是对他实行了上级的命令，返回Auditor将军那里交还三套盔甲后即可离开，回基地后如果有钱可买几发坦克用炮弹。
第十五关 牛顿（Newton）
掠取者的代表团居然来到我们基地求援，他们设在牛顿的大本营遭到机器人部队重创，大量掠取者战士阵亡，为了能说服我们派兵赞助，掠取者表示愿意将他们刚刚发明的一种新式能量武器及其资料赠送给兄弟会，不过我们必须把城中被困的四位掠取者高层官员救出来。看来兄弟会的影响力在日趋扩展，往日的敌人纷纭加入了我们的联盟，这正是对付机器人邪恶权势的最佳机会。
来到牛顿后先看地图，四位掠取者高官散布在标有数字的圆圈领域内。攻入右手边的厂房内，消灭机器人后得到一个工具箱，厂房正门外有辆伤痕累累的坦克，擅长修理的队员用工具箱将其修复即可开走，携带坦克炮弹的队员再上车即可驾驭坦克炮塔，坦克炮威力惊人。从厂房的二楼天桥一路血战到对面大楼，终于找到了掠取者的首席军医官Glenda Close，这位女士似乎对你一见钟情，即使把她护送到沙袋后的安全疏散点，她也仍然不忘表达一番柔情蜜意。大楼里还有不少机器人怪物，如果能避开就别去惹。下楼沿大路向前，路边土里会冒出若干潜地机器甲虫突袭，还有一些能发射火箭弹的浮空机器人和比机器搬运工更厉害的坦克机器人。从篱笆外面绕到城市西边，位于这里的2号楼中可救到外交大使Albert Lamore，但一进楼就有两座火力强劲的炮塔挡路，楼顶上还有一座。
护送Albert达到北角的安全地带后回到救他的处所，下面那栋楼里还有一位期待拯救的。不过路上会冒出更多潜地甲虫，两侧工事后也有机器人频频射击。3号大楼入口在南端，里面根本上仍然为掠取者所掌握。从天井的梯子下去，在有卫兵扼守的屋内见到军事科学官Tobias Peste，他大方陈词一番后交出了旁边保险柜的钥匙，里面是他们新研制的EMP电磁脉冲枪，威力惊人可惜射程只有30。把这家伙送回后方才干再来找最后一位，你不能一次救两位军官。顺着东南的铁皮墙一直溜到入口处，解决了挡路的机器人落后门往左拐，Rodger Gaire将军在一楼的房间里，护送他与其他人会合即可返回基地。
兄弟会最后一次搬家迁往更西面的艾普西龙基地，设在野外的新基地更开阔，大家都住进帐篷里，认为又别有一番风味。
