Mount Massive精神病院曾经因为丑闻而关闭过，在重新开启后打着慈善的名义接受那些无家可归的病人。由于投入的资金过于庞大，这个打着慈善旗号的穆克夫研究组被政府盯上，看似正常的检查报告和有形无形的议员压力让政府部门无法直接干涉。
主角是记者迈尔斯，收到了一封邮件(就是DLC主角软件工程师帕克在DLC最初用笔记本发出的邮件)后8:00开了红色吉普车赶来巨山 精神病院，想要调查清楚事情真相。
巨山精神病院的地图，行政大楼1-3楼 下面就是地下秘密实验室，行政大楼后面则是花园和教堂侧边是男病房、女病房。过渡区是教堂，而且地下秘密实验室应该很大，正篇中的记者坐电梯到了地下秘密实验室，而且根据游戏得知秘密实验室分了至少五个区。
游戏主剧情包括DLC，游戏两部主人公应该是在同步时间差进行双剧情(工程师略早，因为是工程师的邮件让记者后来赶来，但是时间不会差太多，大概12-24小时左右，只不过正主角和副主角未碰面，但是很明显都在同时进行。迈尔斯从正门大厅一直逃到地下研究室。而帕克从地下研究室一直逃离到正门大厅，虽然他们都没有碰面，但是事件却是在同步进行。迈尔斯在收到邮件后来到精神病院大概是12小时之后的事情了。帕克在逃亡一段时间后遇到了正在给迈尔斯画指引路线的神父，这里是一个交叉点。之后帕克在快逃离出精神病院的时候看到了教堂正在着火，此时应该是神父已经完成自燃仪式，按照场景变换，迈尔斯是从行政大厅等跑到三楼然后又下到地下室实验室，而工程师是从实验室逃跑出来，从后厅到行政大厅的，所以时间不冲突(正好迈尔斯到地下室实验室的时候那时候，工程师在地下室发生暴动时间早已经过去了很多。特种部队进入了巨山精神病院，迈尔斯进入了地下研究所的阶段。(别忘了帕克给新郎抓了起来关在柜子里12个小时)
迈尔斯进入地下研究所后在轮椅教授的指使下，杀掉了比利，这时寄生在比利体内的瓦尔里德被释放出来，因为宿主被破坏，而且迈尔斯经历过濒死与恐惧的洗礼满足了寄生条件，就寄生在主角身上。后来迈尔斯被雇佣兵杀掉(博士并不知道主角已被寄生)，由迈尔斯控制的瓦尔里德被成功释放，迈尔斯于是开始大屠杀(貌似只杀坏人)。
帕克在这时逃离到了正门大厅，看到了杰里米·布莱尔。杰里米·布莱尔为了不让穆克夫所做的事情被曝光，在帕克即将迈出大厅正门、逃出生天时用玻璃碎片刺伤了帕克，在杰里米·布莱尔准备再次袭击帕克时，刚成为独立灵魂体的迈尔斯出现干掉了他。(有点像恶梦之屋2的反派博士的死法)
帕克逃出正门大厅，此时太阳升起了，帕克慢慢的跑到了迈尔斯开来的吉普车前，这时候黑影又出现，帕克用DV看到黑影的模样(穿着夹克衣服的样子证明此灵魂体是迈尔斯)迈尔斯明白自己成为了灵魂体，因为各种关系已经出不了巨山精神病院，看到车子貌似发动不了，来推了帕克一把，(仔细观察油表，已经没油了，门不是撞开的，在撞之前的一秒就被黑影打开了。也有网友表示说明明就听到像撞到门一样的声音，那大家就再琢磨琢磨了)让帕克成功逃离。
最后帕克将DV带了出去，巨山精神病院里的这个组织背景庞大。曝光他们的话，不光自己，家人朋友都会受到牵连和报复，但强大的正义感让帕克义无反顾，毫不犹豫的就按下了将DV视频上传到网上曝光组织的按键。
整个故事到此告一段落，但游戏内的文档说明了在《逃生》的世界观中，不光只有比利这个灵魂体，还存在着其他灵魂体，以及有三名被研究对象在这次暴动之前就被转移了出去。以上种种也许游戏制作公司为游戏后续的剧情所埋下伏笔。
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